CoGe: FastaView

CoGe

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Sequence Count: 1 Feature Count: 1

>Clostridium botulinum A strain Hall(v1, unmasked), Name: CLC_0353, YP_001386248.1, ade, Type: CDS, Feature Location: (Chr: 1, 338009..339862) Genomic Location: 338009-339862
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Protein Sequence

DNA Sequence

Download

CoGe Blast

Add Upstream (5'): Add Downstream (3'): Add Seq
Only use feature names in header. Only use CoGe feature id in header.

Off site tools:

CyVerse Semantic Web	Send sequence(s) to the CyVerse/SSWAP semantic discovery service
TARGeT	Tree Analysis of Related Genes and Transposons
Phylogeny.fr	One click phylogeny at Phylogeny.fr
MATTF	Run MAFFT on the sequence(s)
Send to GenFam

ProSite

Scan for protein domains at ProSite.

{"fasta":[{"sequence":"atgtataaaaatatacaaagagaaatctataaaaatacaaaaggagacggggatatgtttaataaatttgatacaaagcctctttgggaggtaagtaaa\nactttatcaagtgtagcacaggggcttgaaccggctgatatggttattataaattcaaggcttataaatgtctgtacaagagaagtcatagaaaacaca\ngatgtagcaattagctgtggaagaattgctttagtaggtgatgcaaaacattgcataggggaaaacacagaggtaattgatgcaaaaggacaatatatt\ngcaccaggttttttagatggtcatattcatgttgaatcatcaatgttaagtgtaagcgaatatgctcgttcagtagttccacatggtactgtcggaata\ntatatggatccacatgaaatttgtaatgtactcggattaaatggtgtacgttatatgattgaagatggcaagggtactccacttaaaaatatggtgacc\nacaccatcctgtgtaccagcagttccaggttttgaagatacaggagcggctgtaggaccagaagatgttagagaaacaatgaagtgggatgaaatagtt\nggattaggagaaatgatgaacttcccaggtatactttattctacagatcatgctcatggagtagtaggagaaactttaaaagctagtaaaacagtaaca\nggacattattctttacctgaaacaggaaaaggattaaatggatatattgcatcaggtgtaagatgttgtcatgaatccacaagagcggaagatgctctt\ngctaaaatgcgccttggaatgtatgcaatgtttagagaaggatctgcatggcatgacttaaaggaagtaagtaaagccattacagaaaataaggtagat\nagtagatttgctgttttaatatctgatgatactcacccacacacattgcttaaggatggacatttagatcatattataaaacgtgctatagaagaaggg\natagagccattaactgcaattcaaatggtaacaataaattgtgcacaatgtttccaaatggatcatgaattaggttctataactccaggaaaatgtgca\ngatattgtatttatagaagatttaaaagatgtaaaaataacaaaggttattatagatggaaatttagttgcaaagggtggactattaactacttcaata\ngctaaatatgattatcctgaagatgctatgaattcaatgcatattaagaataaaataacaccagattcctttaatattatggctcctaataaagaaaaa\nataactgcaagggttattgaaattatacctgaaagagttggtacatatgagagacatgttgaacttaatgttaaagatgataaagttcaatgtgatcca\nagtaaagatgttttaaaagcagttgtatttgaaagacaccatgaaacaggaacagcaggatatggttttgttaaaggttttggtattaagagaggagct\natggctgcaacagttgcccatgatgctcacaacttattagttataggaacaaatgatgaagatatggcattagctgctaatacattaatagaatgtggt\nggaggaatggtagccgtacaagatggtaaagtattaggcttagttccattaccaatagcaggacttatgagtaataagcctttagaagaaatggcagaa\natggtagaaaaactagatagtgcatggaaagaaataggatgtgatatagtttcaccatttatgacaatggcacttattccacttgcctgcctaccagaa\nttaagactaactaatagagggttagttgattgtaataagtttgaatttgtatcattatttgtagaagaataa","stop":339862,"names":["CLC_0353","YP_001386248.1","ade"],"type":"CDS","id":"24036547","organism":"Clostridium botulinum A strain Hall(v1, unmasked)","chromosome":"1","start":338009,"location":"338009..339862"}]}